Działalność wydawnicza Uczelni została zapoczątkowana w 1954 r. uchwałą Senatu powołującą Redakcję Zeszytów Naukowych. Redaktorem Naczelnym został prof. dr Mieczysław Cena. W 1955 r. opublikowano pierwsze zeszyty serii: Rolnictwo i Weterynaria, rok póĹşniej zeszyty serii: Zootechnika oraz Melioracja. W 1958 r. został wydany pierwszy skrypt Przewodnik do ćwiczeń zootechnicznych autorstwa: Tadeusza Olbrychta, Franciszki Olbrychtowej i Bolesława Nowickiego.

W 1961 r., zgodnie z zaleceniem Ministerstwa Szkolnictwa WyĚźszego, dokonano reorganizacji redakcji. Przede wszystkim zmniejszono nakłady zeszytów naukowych, zrezygnowano z funkcji redaktora naczelnego i utworzono stanowisko koordynatora i sekretarza wydawnictw uczelnianych – Zeszyty Naukowe i Skrypty – na które powołano dr. Henryka Balbierza, a na etat technika redakcji Irenę Fałatowicz, która pracowała do roku 1980.

W grudniu 1963 r. utworzono samodzielną jednostkę Uczelni pod nazwą Dział Wydawnictw WyĚźszej Szkoły Rolniczej, której kierownikiem został doc. dr Jerzy Lipanowicz (1963–1964). Po powrocie z zagranicy kierownictwo przejął doc. dr Henryk Balbierz, który tę funkcję pełnił do 1979 r.

W latach 1979–1994 kierownikiem Działu Wydawnictw był mgr Norbert Tomczyk, który równolegle pełnił przywróconą funkcję redaktora naczelnego w latach 1982–1993. Przez siedem miesięcy 1994 r. kierownikiem była Małgorzata Wanke-Jakubowska a sekretarzem Wydawnictwa – wówczas to stanowisko zostało ukonstytuowane – Maria Wanke-Jerie, od 1994 do 2005 r.  pracował jako redaktor naczelny prof. Jerzy Sobota. Od paĹşdziernika 2005 r. funkcję tę pełni prof. Andrzej Kotecki.

W 1994 r. przeprowadzono gruntowną reorganizację działalności wydawniczej Uczelni. Uchwałą Senatu powołano Wydawnictwo Akademii Rolniczej we Wrocławiu w pionie prorektora ds. nauki, ustalono nowy regulamin organizacyjny oraz zasady finansowania działalności wydawniczej, rozwiązano Zakład Poligrafii. Utworzono stanowisko kierownika redakcji technicznej, które w latach 1995–2007 obejmowała mgr Janina Bartkowska. 

Od 20 paĹşdziernika 1994 r. sekretarzem Wydawnictwa jest GraĚźyna Kwiatkowska. W 2008 r. dokonano kolejnej reorganizacji, powołując stanowisko kierownika Wydawnictwa, a od roku 2010 – dyrektora Wydawnictwa – funkcję tę sprawuje dr Ewa Jaworska. Przygotowano nowe zasady funkcjonowania i finansowania jednostki. W 2010 r. rektor zdecydował, Ěźe wszystkie publikacje i materiały reklamowe ukazujące się na Uczelni winny być przygotowywane przez Wydawnictwo. Ponadto, od końca 2010 r., od numeru 201, Wydawnictwo zajęło się publikowaniem czasopisma uczelnianego Głos Uczelni.

W 1999 r. z inicjatywy prof. Jerzego Soboty oraz rektora prof. Tadeusza Szulca polskie uczelnie rolnicze powołały pierwsze polskie naukowe czasopismo wydawane tylko w wersji elektronicznej w Internecie pod nazwą Electronic Journal of Polish Agricultural Universities (www.ejpau. media.pl). Czasopismo redagowane jest w języku angielskim, aktualnie w 11 seriach, przez międzynarodowe kolegia redakcyjne zlokalizowane  w wydawnictwach uczelni rolniczych. Redakcja techniczna czasopisma mieści się w Wydawnictwie Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu, gdzie zlokalizowane były początkowo redakcje trzech serii: Animal Husbandry – Przewodniczący Kolegium Redakcyjnego –  Bolesław Ěżuk, Environmental Development (Jerzy Sobota) i Veterinary Medicine (Wojciech  Zawadzki), a obecnie: ostatnia z wyĚźej wymieniowych oraz Biotechnology (Małgorzata  Robak) i Geodesy and Cartography (najpierw prof. Andrzej Borkowski, następnie prof. Bernard Kontny) Sekretarzem do 2010 r. była Alina Gebel. Czasopismem kieruje Rada Programowa złoĚźona z przedstawicieli uczelni rolniczych, której przewodniczy prof. Jerzy Sobota.

W 2001 r., równieĚź z inicjatywy prof. Jerzego Soboty, rektorzy polskich uczelni rolniczych powołali czasopismo Acta Scientiarum Polonorum w 15 seriach, których redakcje znajdują się na ośmiu uczelniach rolniczych. We Wrocławiu znajdują się trzy: Medicina Weterinaria (pod redakcją prof. Wojciecha Zawadzkiego), Biotechnologia (prof. Danuta Witkowska), Geodesia et Descriptio Terrarum (prof. Andrzej Borkowski). Podobnie jak w przypadku EJPAU czasopismem kieruje Rada Programowa złoĚźona z przedstawicieli uczelni rolniczych, której przewodniczy prof. Jerzy Sobota.

W historii Wydawnictwa powoływano i wydawano szereg serii Zeszytów Naukowych. Z pierwszych czterech do dziś ukazują się Rolnictwo, pod redakcją merytoryczną profesorów – kolejno – Mariana Lityńskiego, Zygmunta Golonki, Józefa DzieĚźyca, Stanisława Kowalińskiego, Jerzego Fabiszewskiego, Henryka Skrabki, Alicji Południak, Andrzeja Koteckiego, Zofii Spiak – 97 zeszytów oraz Zootechnika, kontynuowana od 2006 r. pod zmienionym tytułem – Biologia i Hodowla Zwierząt, pod redakcją merytoryczną profesorów – kolejno – Mariana Junego, Doroty Jamroz, BoĚźeny Chudoby-Drozdowskiej oraz Krystyna Chudoby – 67 zeszytów. Seria Weterynaria ukazywała się do 2001 r., wydano 61 zeszytów, a redaktorami merytorycznymi byli kolejno: prof. Adam Skurski, prof. Józef Dejneka i prof. Wojciech Zawadzki; seria Melioracja była wydawana równieĚź do 2001 r., ukazały się 43 zeszyty, a redaktorami merytorycznymi byli profesorowie: Stanisław Bac senior, Józef Boćko, Jerzy Sobota, Mieczysław Trybała, Józef Sasik. Od końca lat 70. powoływano i zamykano kolejne serie: Rozprawy (1977–2008) – ukazało się 256 zeszytów, a od 2009 r. rozprawy habilitacyjne są wydawane jako indywidualne monografie, Technologia Ěżywności (1979–2011) – 14 numerów, redaktorami merytorycznymi byli kolejno profesorowie: Irena Górska, Wacław Leszczyński, Ewelina Dziuba, Geodezja i Urządzenia Rolne (1980–2004) – 22 numery pod redakcją merytoryczną profesorów Andrzeja Świątkiewicza, następnie Zofii Więckowicz. Ukazało się 5 zeszytów Mechanizacji Rolnictwa (1990–2000) pod redakcją Bronisławy Kram, następnie Włodzimierza Białczyka, w 2007 r. reaktywowano tę serię pod nazwą InĚźynieria Rolnicza, ale wydano tylko jeden numer pod redakcją prof. Włodzimierza Białczyka. Tematyka serii Nauki Społeczne (1983–1994), w której pod redakcją Barbary Goli wydano 8 zeszytów, była kontynuowana w serii Nauki Humanistyczne (1995–2004) – ukazało się 8 zeszytów pod redakcją Piotra Moroza. W serii Konferencje od 1995 do 2005 r. ukazało się 38 zeszytów. Współcześnie tomy zawierające materiały konferencyjne ukazują się jako osobne książki opatrzone numerem ISBN. W serii Bibliografie, pod redakcją mgr Teresy Styczyńskiej, w latach 1996–2006 wydano 11 zeszytów (ostatni w postaci płyty CD). Seria InĚźynieria Środowiska ukazywała się od 1992 do 2006 r. pod redakcją – kolejno – prof. Jerzego Soboty, prof. Włodzimierza Czamary, wydano 15 zeszytów.

W 1994 r. zapoczątkowano osobną serię – Monografie. Do marca 2011 r. ukazały się 122 książki. W obrębie serii Monografie powoływane są serie tematyczne: od 2004 r. – Współczesne problemy inĚźynierii środowiska – 17 tytułów, od 2008 r. – Współczesne problemy architektury krajobrazu – 3 tytuły, od 2010 r. – Współczesne problemy medycyny weterynaryjnej – 4 tytuły, natomiast od 2010 r. Problemy ochrony roślin na terenach zurbanizowanych – 1 tytuł oraz Współczesne problemy budownictwa – 1 tytuł.

Wydawnictwo publikuje równieĚź podręczniki akademickie dofinansowane przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa WyĚźszego.

Działalność wydawniczą w okresie sześćdziesięciolecia (do pierwszego kwartału 2011 r.) zamyka wydanie 52 podręczników, 539 skryptów oraz 646 numerów róĚźnych serii Zeszytów Naukowych i kilkadziesiąt tytułów tomów konferencyjnych, a takĚźe publikacji innego typu.